O Instituto Oceanográfico da Universidade de São Paulo (IOUSP) foi fundado em 1946, como Instituto Paulista de Oceanografia (IPO). Seus objetivos exprimiam a necessidade do desenvolvimento de uma instituição que atuasse em prol da manutenção de bases científicas à pesca e para a exploração de recursos disponíveis no litoral paulista. Em 1951, o Instituto foi anexado à USP como Unidade de Pesquisa, adotando seu nome atual e alcançando maior autonomia no cumprimento de suas funções. Em 1972, foi transformado em Unidade Universitária, passando a conceder cursos de Pós-graduação em nível de mestrado nas áreas de Oceanografia Biológica e Oceanografia Física. O curso de graduação (Bacharelado em Oceanografia) foi aprovado pelo Conselho Universitário em 2001, cuja primeira turma ingressou em 2002.